Différence entre shARN et siARN

ARNsh vs ARNsi

Au cours du processus d'interférence ARN (ARNi), l'expression d'un gène cible est inhibée avec une spécificité et une sélectivité élevées. L'ARNi est un processus naturel qui implique de petits ARN interférents (ARNsi), des ARN en épingle à cheveux courts (shRNA) et des shRNA bifonctionnels. Actuellement, l'ARNi est largement utilisé comme outil de traitement personnalisé du cancer. Les applications de l'ARNi sont essentiellement réalisées avec les molécules de shARN d'ARNsi et de vecteurs à double brin synthétisées chimiquement. Bien que ces deux molécules aient des résultats fonctionnels similaires, elles diffèrent par leur structure; ainsi, les mécanismes d'action moléculaires, les voies de l'ARN et les effets hors cible de ces deux molécules diffèrent également.

shARN

Le shRNA est une séquence de petite molécule d'ARN qui fait un virage serré en épingle à cheveux qui peut être utilisé pour faire taire l'expression d'un gène cible au cours de l'ARNi. L'expression de l'ARNsh est réalisée par un vecteur, qui peut être un virus ou une bactérie ou par la délivrance de plasmides. Ils sont synthétisés dans le noyau des cellules et transportés vers le cytoplasme pour des processus ultérieurs. Ces molécules ont des voies de maturation similaires du miARN; ainsi, la synthèse des miARN a fourni les bases de la compréhension de la synthèse des shRNA. L'ARN polymérase II ou III peut transcrire le shRNA par l'intermédiaire de promoteurs d'ARN polymérase II ou III. L'avantage de l'utilisation des shRNA est qu'ils ont un taux de dégradation et de renouvellement relativement faible. L’inconvénient est qu’il faut un vecteur d’expression, ce qui peut poser des problèmes de sécurité..

siRNA

Les siRNA sont des molécules d'ARN double brin composées de 20 à 25 paires de bases. Ceux-ci sont utilisés pour la suppression de gènes en réduisant au silence tout gène ayant une séquence nucléotidique complémentaire dans la voie de l'ARNi. L'inactivation génique par transfection d'ARNsi échoue souvent en raison de l'effet transitoire; en particulier dans les cellules à division rapide et la suppression ne dure pas plus longtemps. Pour surmonter ce problème, le siARN est modifié en introduisant une structure en épingle à cheveux courte. Cette molécule modifiée est alors connue sous le nom de shRNA. shRNA doit être converti en siRNA par un Dicer afin de poursuivre sa fonction normale.

Quelle est la difference entre shRNA et siRNA?

• À la différence du siRNA, le shRNA a une structure supplémentaire en épingle à cheveux. shRNA est une version modifiée de siRNA.

• shARN requiert un vecteur d’expression, alors que siARN ne.

• Le shRNA peut être utilisé pour le knockdown à long terme, tandis que le siRNA ne peut être utilisé que pour le knockdown à court terme de gènes..

• Contrairement à la suppression des gènes de l'ARNsi, la suppression de l'ARNsh dure longtemps et, si elle est insérée via un vecteur viral approprié, elle peut avoir des effets d'inhibition du gène permanents..

• Dicer est nécessaire pour reconvertir le shRNA en molécule de siARN afin d'exécuter ses fonctions normales.