Différence entre l'agarose et le polyacrylamide

Agarose vs Polyacrylamide

Il existe diverses différences relatives à l'agarose et au polyacrylamide, y compris leur structure physique, leur toxicité et leurs méthodes de coulée, ainsi que leur prix. Il est utile de connaître ces différences, ainsi que leurs similitudes, si vous utilisez l'un ou l'autre de ces types de gels..

L'une des principales différences entre ces deux gels est que l'agarose est versé horizontalement, tandis que le Polyacrylamide est versé verticalement. Il est beaucoup plus facile de verser de l'agarose de cette manière horizontale. L’agarose peut être chauffé pour faciliter le processus de coulée, mais ne doit pas être chauffé à un degré tel que l’agarose finisse par fondre. On peut aussi décider d’utiliser des voies étroites ou larges pour verser l’agarose. Il est possible de couler en utilisant cette méthode de rainurage, et c'est l'un de ses avantages. En versant, il faut être extrêmement prudent, car l’agarose est très délicate et peut facilement se casser..

Par ailleurs, comme mentionné, le polyacrylamide est versé verticalement. Le polyacrylamide a besoin de plaques de verre pour faciliter ce processus, car sa structure est très mince et ce support supplémentaire est nécessaire. Contrairement à l’agarose, le polyacrylamide ne peut pas être réchauffé puis versé.

L'agarose est composé de nombreuses molécules, alors que le polyacrylamide est généralement constitué d'une seule grande molécule. Les molécules d'agarose sont maintenues ensemble par des forces intermoléculaires, et les molécules sont constituées d'ADN. Il existe de grandes et de petites molécules et, en général, les molécules les plus grandes sont plus faciles à séparer que les plus petites. La molécule de polyacrylamide est composée d’ADN ou de protéines. Les espaces entre les gels de polyacrylamide sont plus petits que ceux entre les gels d'agarose, ce qui constitue une autre différence entre ces deux substances. Lorsque la taille des bandes est la même dans l'agarose, il existe différentes tailles de bandes dans le Polyacrylamide. Si la molécule de polyacrylamide est exposée à l'air, elle ne se solidifiera pas de manière uniforme, l'air fixant le processus de polymérisation..

En ce qui concerne la toxicité, l'agarose est considérée comme une substance non toxique. Bien que le polyacrylamide soit considéré comme identique, sa poudre est considérée comme toxique et il est sage de manipuler même les gels avec des mesures de protection..

Le polyacrylamide est utilisé pour le séquençage des gels et des gels de protéines. Ses avantages sont qu’il a des propriétés de coloration faciles et qu’il peut être séché pour former un gel. Il est acheté pré-versé et coûte moins cher que l’agarose, à environ 5 dollars US par gel. (L’agarose coûte environ 1 dollar par gramme). Il est recommandé à une personne d'avoir une expérience suffisante avant d'acheter l'un ou l'autre de ces deux gels, car souvent, le nombre d'échantillons requis et la concentration du gel nécessaire doivent être connus avant tout achat..

Résumé:

1.Agarose est versé horizontalement, alors que Polyacrylamide est versé verticalement.
2.L'agarose est plus cher que le polyacrylamide.
3. L’agarose est composé de nombreuses molécules, tandis que le polyacrylamide est constitué d’une seule grande molécule..
4. Contrairement au polyacrylamide, l'agarose peut être réchauffé.
5.L'agarose est considéré comme une substance non toxique sous toutes ses formes, tandis que la poudre de polyacrylamide est considérée comme toxique..