Différence entre Motif et Domaine

le différence clé entre motif et domaine est que le le motif n'est pas indépendamment stable alors que le domaine est indépendamment stable.

Les protéines sont des macromolécules biologiques importantes présentes dans notre corps. D'autre part, le code génétique d'un gène décidera de la séquence d'acides aminés d'une protéine. De plus, les protéines ont des structures primaires, secondaires et tertiaires. La structure primaire est la séquence d'acides aminés de la chaîne polypeptidique. Lorsque les chaînes polypeptidiques se plient les unes aux autres, cela forme la structure secondaire de la protéine. Les hélices alpha, les feuilles bêta et les structures super-secondaires appartiennent aux structures secondaires. Certains groupements d’éléments super-secondaires sont appelés motifs protéiques. La structure tertiaire d'une protéine fait référence à sa structure tridimensionnelle qui décide de la fonction de la protéine. Domain est une section pliée d'une molécule de protéine, globulaire et dotée d'une fonction discrète. C'est la structure fonctionnelle et tridimensionnelle fondamentale de la protéine.

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Quel est le motif
3. Quel est le domaine
4. Similarités entre Motif et Domain
5. Comparaison côte à côte - Motif et domaine sous forme tabulaire
6. Résumé

Quel est le motif?

Motif est un certain regroupement des éléments super secondaires des protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta. Ils sont une sorte de modèles présents dans différentes protéines. Les motifs décrivent les modèles de pliage des éléments structuraux secondaires et leurs interactions. Ces modèles de pliage se stabilisent par des liaisons similaires présentes dans les structures tertiaires. Cependant, ils ne sont pas aussi complexes que les structures tertiaires.

Figure 01: Motif

Ce sont de simples combinaisons de structures secondaires de protéines. Motif n'est pas stable en soi. De plus, les motifs expliquent la structure d'une protéine mais ne prédisent pas la fonction d'une protéine. Des exemples de motifs protéiques sont un motif bêta-alpha-bêta, un motif clé grec, un corps bêta, un motif bêta-méandre, etc..

Quel est le domaine?

Le domaine est une unité fondamentale, fonctionnelle et tridimensionnelle d’une protéine. Il remplit une fonction particulière. Une seule protéine peut avoir plusieurs domaines distincts. Chaque domaine est une unité indépendante. C'est une structure globulaire. Il est responsable d'une fonction ou d'une interaction spécifique. Les domaines peuvent être utilisés pour émettre une hypothèse sur la fonction d’une protéine non caractérisée. Lors de l’analyse d’une protéine, il est essentiel de prendre en compte car les domaines sont les unités fonctionnelles de la protéine..

Figure 02: Trois domaines différents de la pyruvate kinase

Les domaines sont des structures très stables et compactes. Ils peuvent être facilement distingués des autres régions. La pyruvate kinase a trois domaines distincts, comme le montre la figure 02. La longueur du domaine peut varier et la longueur moyenne est de 100 acides aminés. Chaque domaine contient un noyau hydrophobe construit à partir d'unités structurelles secondaires. Plusieurs domaines font collectivement la structure tertiaire d’une protéine.

Quelles sont les similitudes entre Motif et Domain?

• Motif et domaine sont des unités présentes dans les molécules de protéines elles-mêmes.
• Ils sont utiles lors de la classification des familles de protéines.

Quelle est la différence entre Motif et Domain?

Motif est un certain regroupement des éléments super secondaires des protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta alors que le domaine est l'unité fonctionnelle d'une protéine. De plus, le motif est une structure secondaire alors que le domaine est responsable de la structure tertiaire de la protéine. De plus, domain est une unité indépendante, contrairement à un motif. En outre, le domaine décrit la fonction d'une protéine alors que le motif ne l'est pas. Ce sont les principales différences entre motif et domaine. L'infographie ci-dessous présente la différence entre motif et domaine sous forme de tableau.

Résumé - Motif vs Domain

Motif est un arrangement de structures secondaires de la molécule de protéine. Il n'est généralement pas stable en soi, contrairement à un domaine. Domain est une structure indépendamment stable d'une protéine. Par conséquent, il peut s'agir d'une molécule protéique partielle ou complète. C'est une unité fonctionnelle fondamentale en trois dimensions de la protéine. De plus, il remplit une fonction et constitue une unité indépendante. Motif peut faire partie du domaine. Mais le domaine ne peut pas faire partie d'un motif. C'est la différence entre motif et domaine.

Référence:

1. «Domaine protéique». Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31 juillet 2018. Disponible ici

Courtoisie d'image:

1. "Motif clé de la protéine de la toxine du charbon" par NatelewisTravail à titre indicatif (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons
2. "Domaines protéiques de la pyruvate kinase" de Thomas Splettstoesser - Travail personnel, (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons