Différence entre protéomique ciblée et non ciblée

La principale différence entre la protéomique ciblée et non ciblée est que la la protéomique ciblée vise à mesurer l'abondance d'une protéine spécifique alors que la protéomique non ciblée ne cible pas une protéine spécifique.

La protéomique est l'étude à grande échelle des protéines, de leurs structures et de leurs fonctions. Il étudie le complément protéique entier dans une cellule, un tissu ou un organisme dans des conditions spécifiques. Il existe deux types de protéomique: la protéomique ciblée et la protéomique non ciblée..

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que la protéomique ciblée?
3. Qu'est-ce que la protéomique non ciblée?
4. Similarités entre la protéomique ciblée et non ciblée
5. Comparaison côte à côte - Protéomique ciblée vs protéomique non ciblée sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la protéomique ciblée??

Comme son nom l'indique, la protéomique ciblée cible une protéine ou un peptide spécifique dans un mélange complexe de protéines à analyser. Ensuite, il analyse la présence et la quantité de cette protéine spécifique présélectionnée. Cette méthode est possible pour un seul échantillon ou pour plusieurs échantillons. Cette méthode convient même pour un groupe spécifique de protéines. Il en résulte des données plus précises, quantitatives et sensibles. De plus, la spectrométrie de masse couplée à une protéomique ciblée permet d'obtenir des mesures fiables plus précises. Cette méthode utilise un spectromètre de masse triple quadripôle (QQQ) pour son analyse.

Figure 01: Protéomique

La protéomique ciblée est une méthode appropriée si vous souhaitez vérifier si une cible de knock-down est réellement renversée ou si vous souhaitez quantifier une protéine / un peptide particulier dans le sérum sanguin, le liquide cérébral ou le lysat cellulaire, etc. Vous pouvez également l'utiliser si vous le souhaitez. vérifier si une protéine particulière est exprimée de manière différentielle entre les échantillons ou au cours d'une expérience dans le temps.

Qu'est-ce que la protéomique non ciblée??

La protéomique non ciblée, comme son nom l'indique, ne cible pas une protéine ou un peptide spécifique pour son analyse. Découverte protéomique est un autre nom pour la protéomique non ciblée. En fait, il s’agit d’une analyse plus «globale». De manière générale, réaliser une protéomique non ciblée revient à répondre à la question «quelles sont les protéines présentes dans cet échantillon ou dans plusieurs échantillons?». Cette méthode n’est pas sensible en tant que protéomique ciblée. Mais il peut identifier et mesurer de nombreuses protéines, y compris de nouvelles protéines. La protéomique non ciblée peut produire des mesures quantitatives et qualitatives.

Quelles sont les similitudes entre la protéomique ciblée et non ciblée??

• La protéomique ciblée et non ciblée mesure les protéines dans des échantillons.
• Ils sont importants dans l'analyse du protéome.
• Ces méthodes utilisent la spectrométrie de masse.

Quelle est la différence entre la protéomique ciblée et non ciblée??

Premièrement, la protéomique ciblée est la détermination de la présence et de la quantité d’une protéine ou d’un peptide particulier dans un mélange complexe de protéines. En revanche, la protéomique non ciblée est l’étude quantitative et qualitative des protéines présentes dans un échantillon ou dans des échantillons sans cibler une protéine particulière. La protéomique ciblée est réalisée avec des protéines présélectionnées ou ciblées, tandis que la protéomique non ciblée est effectuée pour déterminer les types de protéines de cet échantillon. De plus, la protéomique ciblée est plus sensible que la protéomique non ciblée.

Résumé - Protéomique ciblée vs protéomique non ciblée

En résumé, la protéomique ciblée et non ciblée sont deux types d’études protéiques. Comme leur nom l'indique, la protéomique ciblée cible une protéine spécifique, tandis que la protéomique non ciblée ne cible pas une protéine spécifique. C’est la différence entre la protéomique ciblée et non ciblée.

Référence:

1. «Protéomique ciblée». UC Davis Proteomics Core, Disponible ici.
2. “Protéomique / Introduction à la protéomique.” Théorie musicale / Modes - Wikibooks, des livres ouverts pour un monde ouvert, Disponible ici.

Courtoisie d'image:

1. "Protéomique" Par Xxl7441 sur Wikibooks Anglais - Transféré de en.wikibooks à Commons (Domaine Public) via Wikimedia Commons