Différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique

Différence clé entre la banque d'ADNc et la bibliothèque génomique
 

Il existe deux principaux types de banques d’ADN construites par des scientifiques utilisant des techniques de génie génétique. Il s’agit de la bibliothèque d’ADNc et de la bibliothèque génomique. le différence clé entre la bibliothèque ADNc et génomique est que La banque d'ADNc contient l'ADN complémentaire cloné de l'ARNm total d'un organisme alors que la banque d'ADN génomique contient les fragments clonés du génome entier d'un organisme.. La banque d’ADN génomique est plus grande que la banque d’ADNc.

CONTENU
1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que la bibliothèque d'ADNc?
3. Qu'est-ce que la bibliothèque génomique?
4. Comparaison côte à côte - ADNc vs bibliothèque génomique
5. Résumé

Qu'est-ce qu'une bibliothèque génomique??

Une banque d'ADN génomique est une collection de clones portant les fragments d'ADN génomique total d'un organisme. Il contient tout l'ADN génomique de cet organisme, y compris les séquences codantes et non codantes. La construction d'une banque génomique est réalisée par la technologie de l'ADN recombinant suivie d'un clonage (génie génétique). La construction comporte différentes étapes, comme le montre la figure 01. Le processus commence par l'isolement de l'ADN génomique. En utilisant un protocole d'extraction d'ADN approprié, l'ADN génomique total d'un organisme devrait être isolé. Ensuite, l'ADN doit être converti en tailles gérables ou en fragments spécifiques par des endonucléases de restriction (enzymes de coupe d'ADN). L'ADN fragmenté doit être inséré dans les vecteurs à l'aide d'ADN ligases (ADN joignant les enzymes). Un vecteur est un organisme auto-répliquant. Les plasmides et les bactériophages sont des vecteurs couramment utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant. Ces vecteurs ligaturés sont connus sous le nom de molécules d'ADN recombinant car ils portent à la fois des séquences d'ADN propres et insérées. Des vecteurs recombinants sont ajoutés à une bactérie hôte et amenés à absorber les vecteurs recombinants à l'intérieur de la cellule bactérienne. Les bactéries avec des vecteurs recombinants (plasmides) doivent être cultivées dans un milieu de culture. Au cours de la multiplication bactérienne, l'ADN bactérien, ainsi que les plasmides recombinants, répliquent leurs génomes et produisent des clones. Ces clones contiennent le génome entier de l'organisme source. Par conséquent, cela s'appelle une bibliothèque génomique. Les plasmides peuvent facilement être séparés de l'ADN chromosomique bactérien pour construire la banque génomique de cet organisme. Si un organisme particulier contient des gènes intéressés, il est facile de le détecter dans la bibliothèque génomique par hybridation à l'aide de sondes moléculaires (marqueurs)..

Les bibliothèques génomiques sont importantes pour étudier la structure et la fonction génomiques, des gènes spécifiques, la localisation des gènes, la cartographie des gènes, les mutations, le séquençage des gènes, l'identification de nouveaux gènes thérapeutiques, etc..

Figure_1: Construction d'une bibliothèque génomique

Qu'est-ce qu'une bibliothèque d'ADNc??

Une bibliothèque d'ADNc est une collection de clones d'ADN complémentaire (ADNc) synthétisés à partir d'ARNm total d'un organisme. La procédure de construction comporte différentes étapes. La purification de l'ARNm total d'un organisme est la première étape. Les ARNm isolés sont convertis en brins d'ADNc par un processus appelé transcription inverse. La transcription inverse est facilitée par une enzyme appelée transcriptase inverse. Il utilise une petite amorce 3 'et initie la synthèse du premier brin d'ADNc complémentaire du brin d'ARNm matrice. Les ADNc double brin résultants sont convertis en fragments plus petits en utilisant des endonucléases de restriction et insérés dans des vecteurs appropriés. Ces molécules recombinantes construites sont ensuite ajoutées dans un organisme hôte et cultivées dans un milieu de culture pour produire des clones. La collection de clones contenant des fragments d'ADNc d'un organisme est connue sous le nom de banque d'ADNc. Les ARNm matures entièrement tranchés ne contiennent ni introns ni régions régulatrices. Par conséquent, les fragments non codants ne sont pas présents dans les banques d’ADNc, contrairement à une banque génomique..

Les banques d'ADNc sont importantes pour l'analyse des régions codantes, des fonctions des gènes, de l'expression des gènes, etc..

Figure_2: Construction d'une bibliothèque d'ADNc

Quelle est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique?

Bibliothèque d'ADNc vs génomique
La banque d'ADNc est une collection de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm d'un organisme.	La bibliothèque génomique est une collection de clones portant l’ADN génomique total d’un organisme..
Codage vs séquences non codantes
La bibliothèque d'ADNc ne contient que les séquences codantes; il ne contient pas d'introns.	La bibliothèque génomique comprend l’ADN génomique complet, y compris l’ADN non codant (introns et régulateur)..
Taille
La bibliothèque d'ADNc est petite.	La bibliothèque génomique est grande.
Materiel de départ
Le matériel de départ est l'ARNm	Le matériel de départ est l'ADN.
Implication de la transcription inverse.
La transcription inverse a lieu lors de la synthèse du premier brin d'ADNc.	La transcription inverse ne se produit pas.

Résumé - Bibliothèque d'ADNc et génomique

La bibliothèque génomique représente une population de clones portant l'ADN génomique total fragmenté d'un organisme. La banque d'ADNc représente la population de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm total d'un organisme. Un clone d'ADNc ne contient que les séquences trouvées dans l'ARNm, tandis que le clone génomique contient les séquences du génome entier. C’est la différence entre l’ADNc et la bibliothèque génomique.

Référence:
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. «Différence entre génomique et bibliothèque d’ADNc». Différence entre génomique et bibliothèque d’ADNc. N.p., n.d. Web. 15 février 2017
2. Stekel, Dov J., Yoav Git et Francesco Falciani. "La comparaison de l'expression génique à partir de plusieurs bibliothèques d'ADNc." Genome Research. Cold Spring Harbor Laboratory Press, décembre 2000. Web. 16 février 2017
3. «Écrans de la bibliothèque génomique pour les gènes impliqués dans la tolérance au n-butanol chez Escherichia coli. N.p., n.d. Web. 16 février 2017

Courtoisie d'image:
1. “Formation d’une bibliothèque d’ADNc” Par PhD Dre sur Wikipedia anglais (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons
2. «Construction d'une bibliothèque génomique» par Aluquette - Travail personnel (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons