Différence entre l'amorce directe et inverse

Différence clé - En avant vs amorce inverse
 

La réaction en chaîne de la polymérase (PCR) est une méthode d’amplification de l’ADN utilisée dans les applications de biologie moléculaire. C'est une technique couramment utilisée qui produit des millions, voire des milliards, de copies d'une séquence d'ADN particulièrement intéressée. C'est un in vitro méthode réalisée en laboratoire. La technique de PCR dépend totalement de l’ADN polymérase produite dans le commerce, appelée Taq polymérase. Et aussi, il nécessite plusieurs autres composants et un bon maintien de la température. Un composant important est les amorces. Les amorces sont les séquences d'ADN courtes spécifiquement conçues pour la séquence d'ADN cible. Ils ont généralement une longueur d'environ 20 nucléotides. La Taq polymérase catalyse l'addition de nucléotides dans une séquence de nucléotides préexistante. Par conséquent, les amorces sont utilisées comme points de départ de la synthèse de nouveaux brins. La Taq polymérase ne fonctionne que dans les directions 5 'à 3', de sorte que la synthèse de l'ADN a lieu dans la même direction 5 'à 3'. Comme l'ADN est double brin, deux types d'amorces sont nécessaires en PCR. Ils sont connus comme amorce directe et amorce inverse. Les amorces directes et inverses sont appelées en fonction de la direction de l'allongement de l'amorce dans l'ADN lorsque la synthèse de l'ADN a lieu. L'amorce Forward s'annelle avec le brin d'ADN antisens et initie la synthèse du brin + ve du gène dans la direction 5 'à 3'. L'amorce inverse s'annelle avec le brin sens et initie la synthèse du brin complémentaire du brin codant; qui est -ve le brin du gène dans 5 'à 3' direction. C'est le différence clé entre les amorces directe et inverse.

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce qu'une introduction
3. Qu'est-ce qu'une amorce inverse
4. Similarités entre l'amorce directe et inverse
5. Comparaison côte à côte - Apprêt direct vs inversé sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce qu'une introduction?

L'orientation vers l'avant est la synthèse du brin codant ou du brin sens d'un gène. La Taq polymérase catalyse la synthèse d'un nouveau brin dans le sens 5 'à 3'. La synthèse du brin codant a lieu lorsque l’amorce s’annelle avec le brin non codant ou antisens et s’allonge dans le sens 5 'à 3'.

Figure 01: Amorces avant et arrière

L'amorce qui s'annelle avec le brin antisens ou avec le brin non codant ou avec le brin matrice est appelée amorce directe, car l'amorce directe sert de point de départ à la synthèse du brin codant ou positif du gène. L'amorce directe a une courte séquence de nucléotides qui est complémentaire à l'extrémité 3 'adjacente du brin antisens. Il s'hybride avec le brin antisens et facilite la polymérase Taq pour ajouter des nucléotides complémentaires du brin matrice..

Qu'est-ce qu'une amorce inverse?

L'amorce inverse est la courte séquence d'ADN qui s'annule avec l'extrémité 3 'du brin sens ou du brin codant. L'amorce inverse sert de point de départ pour la synthèse d'un brin complémentaire de la séquence codante ou de la séquence non codante. L'amorce inverse est conçue comme complémentaire de l'extrémité 3 'du brin de codage. Par conséquent, il s'annelle avec l'extrémité 3 'adjacente du brin codant et permet à la polymérase Taq de synthétiser le brin antisens ou le brin matrice. Comme son orientation est inversée, cette amorce est appelée amorce inverse..

Les amorces inverses et directes sont importantes pour la production de millions, voire de milliards, de copies de régions particulières de l'ADN qui sont ciblées ou intéressées..

Quelles sont les similitudes entre l'amorce directe et inverse?

• Les amorces directe et inverse sont fabriquées à partir d'oligonucléotides.
• Les amorces directe et inverse possèdent toutes les deux une séquence nucléotidique complémentaire aux extrémités adjacentes des doubles brins de l'ADN..
• Les amorces directe et inverse consistent généralement en 20 nucléotides.
• Les amorces directe et inverse sont utilisées dans les réactions en chaîne de la polymérase.
• Les amorces directe et inverse sont synthétisées commercialement.
• Les amorces directes et inverses sont stables en température et ont normalement une Tm similaire..
• Les amorces directe et inverse sont toutes deux recuites avec les séquences d’ADN cibles..
• Les amorces directe et inverse sont conçues en fonction des réactions de PCR.
• Les amorces directe et inverse sont utilisées comme points de départ pour l’amplification de l’ADN..
• Les amorces inverses et directes sont toutes deux importantes pour la production de millions de copies de régions particulières de séquences d'ADN ciblées ou intéressées..

Quelle est la différence entre l'amorce directe et inverse?

Apprêt avant vs apprêt inverse
L'amorce directe est la courte séquence d'ADN qui s'hybride avec l'extrémité 3 'du brin non codant ou du brin matrice du gène et sert de point de départ pour la synthèse de la séquence codante..	L'amorce inverse est la courte séquence d'ADN qui s'hybride avec l'extrémité 3 'du brin codant ou du brin non modèle et sert de point de départ pour la synthèse de la séquence non codante..
Brin de recuit
Primer Forward recuit avec brin de modèle.	L’amorce inverse recuit avec le fil non-modèle.
Nouvelle séquence résultante
L’amorce avant facilite la synthèse de la séquence codante.	L'amorce inverse facilite la synthèse de la séquence non codante.

Résumé - Transférer vs amorce inverse

Il existe deux types d'amorces impliquées dans la technique de PCR. Ce sont des amorces directes et inverses. Sur la base de l’allongement de l’amorce lors de la synthèse d’un nouveau brin d’ADN, ces amorces sont marquées ou nommées. La Taq polymérase synthétise le nouvel ADN dans une orientation de 5 'à 3'. Par conséquent, les amorces sont conçues comme complémentaires aux extrémités 3 'des doubles brins. L'amorce directe qui s'allonge dans la direction 5 'à 3' s'hybride avec l'extrémité 3 'de l'antisens ou du modèle ou de la séquence non codante. Il sert de point de départ pour synthétiser une séquence codante. L'amorce inverse qui s'allonge dans la direction 5 'à 3' s'hybride avec l'extrémité 3 'du codage ou du non-modèle ou du brin sens. Il sert de point de départ pour synthétiser la séquence non codante. C’est la différence entre l’amorce directe et inverse..

Référence:

1. “Primer (biologie moléculaire).” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 20 février 2018. Disponible ici 
2. «Réaction en chaîne de la polymérase (PCR)». Khan Academy. Disponible ici 

Courtoisie d'image:

1.'Primers RevComp Melted2'By Richard Wheeler (Zephyris) - Travail personnel, (CC BY-SA 3.0) via Wikimedia Commons