Différence entre Knockout et Knockdown des gènes

le différence clé entre le knockout et le knockdown est que le knockout est une technique dans laquelle le gène d’intérêt est complètement éliminé (état inopérant) étudier les fonctions du gène tout en knockdown est une autre technique où le gène d’intérêt est réduit au silence étudier le rôle du gène en question dans un système biologique.

Différentes techniques génétiques sont utilisées pour étudier le fonctionnement des gènes dans les systèmes biologiques vivants. Le knockout et le knockdown géniques sont deux techniques de ce type. Ces techniques aident les scientifiques à identifier les aspects fonctionnels de différents gènes chez des organismes vivants.

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que Gene Knockout?
3. Qu'est-ce que Gene Knockdown?
4. Similitudes entre Knockout et Knockdown des gènes
5. Comparaison côte à côte - Gene Knockout vs Knockdown sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que Gene Knockout??

L'inactivation de gène est une technique génétique qui rend inopérant un ou plusieurs gènes chez les organismes vivants. C'est aussi un processus qui consiste à éteindre ou à supprimer un gène d'un organisme. La principale application de cette technique consiste à étudier la fonction du gène. Le processus évalue l'effet du gène perdu ou retiré. Le processus d'inactivation implique également certaines enzymes et techniques d'épissage.

Figure 01: Knockout du gène

Il existe peu de variations dans la technique d'inactivation des gènes en fonction du nombre de gènes impliqués. Elles sont double KO (KO de deux gènes), triple KO (knock-out de trois gènes) et KO quadruple (KO de quatre gènes). Le knockout de gènes est en outre classé en deux groupes; knockouts hétérozygotes et knockouts homozygotes.

Qu'est-ce que Gene Knockdown??

La suppression de gène est une procédure expérimentale dans laquelle cette procédure supprime ou réduit l'expression d'un gène particulier ou de gènes d'un organisme.. Gene Silencing est la définition commune du gène knockdown. Au cours de cette procédure, l'activation ou la dégradation de l'ARNm produit implique une interférence d'ARN (ARNi), un petit ARN interférent (siRNA) et un ARN en épingle à cheveux court (shRNA).

Figure 02: Silençage génique

La principale utilisation du gène knockdown est d'étudier le rôle du gène en question dans le système biologique. Par conséquent, cette technique permet d’étudier les oncogènes (Bcl-2 et P53) et les gènes responsables de maladies neurologiques, d’infections virales et de maladies héréditaires..

Quelles sont les similitudes entre Gene Knockout et Knockdown?

• L’inactivation et la désactivation de gènes sont des techniques génétiques.
• Ces deux techniques peuvent empêcher l'expression des gènes.
• L’utilisation principale des deux techniques consiste à étudier la fonction du gène d’intérêt.
• Les deux sont capables d'identifier différentes pathologies (génétiques).
• Ils pourraient tous deux être utilisés pour un ou plusieurs gènes d’intérêt.

Quelle est la difference entre Gene Knockout et Knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
KO Gene est en fonctionnement de gènes (retrait de gènes de l'ADN) d'un organisme par le biais de différentes techniques génétiques.	Dépression de gènes est une procédure expérimentale pour supprimer (réduire ou faire taire) l'expression d'un gène particulier ou de gènes d'un organisme.
Une fonction
Facilite l'étude des fonctions des gènes en analysant les résultats du gène perdu.	Facilite l'étude des oncogènes, gènes responsables de maladies neurologiques, d'infections virales et de maladies héréditaires.
Implication des agents d'ARN
L'implication des agents d'ARN est insignifiante dans cette technique.	Le processus implique des agents tels que le siARN, le shARN et l’ARNi pour inactiver l’ARNm.
Utilisation d'agents chimiques
Des agents enzymatiques sont utilisés.	Aucun de ces agents chimiques n'est utilisé.
Effet sur le gène
Élimine complètement le gène de l'ADN.	Supprimer ou faire taire le gène.
Classification
Double knockout, triple knockout et knockout quadruple et knockout hétérozygote et homozygote sont différents types de knockout génique.	Aucun système de classification de ce type disponible pour le silençage des gènes.

Résumé - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Les deux techniques dont nous avons discuté ici; le knockout et le knockdown, sont des méthodes pour étudier les fonctions de différents gènes. L'inactivation génique rend complètement le gène inopérant, tandis que l'inactivation génétique inhibe le gène en question. Cependant, les deux procédures empêchent l'expression du gène. Différents agents sont capables d'accomplir ces deux processus. L'inactivation génique est un type de délétion, tandis que l'inactivation génique est un type d'inactivation. C’est la différence entre le knock out et le knockdown.

Référence:

1. Shaffer, Catherine. "Gene Knockout versus Knockdown." News-Medical.net, 12 février 2018. Disponible ici  
2. «Gene Knockout». Nature News, Groupe d’édition Nature. Disponible ici

Courtoisie d'image:

1.'Knockout Mice5006-300'Par Maggie Bartlett, NHGRI. (Domaine public) via Wikimedia Commons 
2. 'ARNI-simplifié' Par Matzke MA, Matzke AJM (2004) Planter les graines d'un nouveau paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC PAR 2.5) via Wikimedia Commons