Différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique

le différence clé entre l’ADN génomique et l’isolement de l’ADN plasmidique est que le L'isolation de l'ADN génomique cible l'extraction de l'ADN génomique tandis que l'isolation de l'ADN plasmidique cible l'extraction de l'ADN plasmidique de la bactérie.

L'isolement de l'ADN est un processus chimique utilisé pour isoler l'ADN de différentes espèces ou de différents échantillons. L'isolation de l'ADN est importante dans les techniques de biologie moléculaire en aval, telles que l'électrophorèse sur gel, la réaction en chaîne de la polymérase et le séquençage de l'ADN. Par conséquent, l'isolement de l'ADN est un processus chimique essentiel dans les études de biologie moléculaire. En fonction du but de la recherche, il est parfois nécessaire d’isoler l’ADN génomique. De plus, certaines études se concentrent sur l'isolement de l'ADN plasmidique de bactéries. L'isolation de l'ADN génomique est le processus d'isolation de l'ADN génomique à partir d'un échantillon procaryote ou eucaryote. Les étapes d'isolement diffèrent selon le type de cellule dans laquelle l'ADN est isolé. L'isolement de l'ADN plasmidique est le processus consistant à isoler l'ADN plasmidique d'une cellule bactérienne. En comparaison avec l'isolement de l'ADN génomique, le processus global est complexe dans l'isolement de l'ADN plasmidique.

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN génomique?
3. Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN plasmidique?
4. Similitudes entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique
5. Comparaison côte à côte - ADN génomique vs isolement d'ADN plasmidique sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN génomique??

L'isolation de l'ADN génomique est le processus d'extraction de l'ADN génomique complet d'un organisme. Ce processus particulier implique trois événements principaux. Ce sont la lyse cellulaire ou la lyse nucléaire, la dégradation des protéines ou la protéolyse et la précipitation de l'ADN génomique. L'étape de lyse peut différer selon le type de cellule. Chez les procaryotes, étant donné qu'il existe une paroi cellulaire en peptidoglycane, la première étape devrait être la dégradation de la paroi cellulaire. En revanche, chez les eucaryotes, l’étape de la lyse implique la rupture de la membrane plasmique et de la membrane nucléaire pour extraire l’ADN vers l’extérieur. En revanche, des étapes spéciales sont essentielles pour lyser les parois cellulaires de la plante et des champignons..

Figure 01: Isolement de l'ADN génomique

En conséquence, une fois l’étape de lyse terminée, l’ADN finira par arriver au surnageant. Simultanément, la solution se dégrade également dans la solution en raison de l'ajout de protéinase K. L'étape suivante consiste à séparer l'ADN génomique des protéines dégradées. Par conséquent, les protéines dégradées se séparent par précipitation permettant à l'ADN génomique de rester dans le surnageant. Après la précipitation des protéines, l'ADN génomique peut être précipité et remis en suspension dans un tampon approprié jusqu'à ce qu'il soit nécessaire pour l'expérience..

L'ADN génomique, qui est un ADN linéaire, contient toutes les informations génétiques d'un organisme. En d'autres termes, le génome est le matériel héréditaire d'un organisme vivant qui est responsable de toutes les activités structurelles et fonctionnelles de la cellule. Il comprend des séquences d'ADN codantes et non codantes. Lors de l'isolement de l'ADN génomique, il comprend tout le génome de l'organisme..

Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN plasmidique??

L'isolement de l'ADN plasmidique est un processus spécial et plus complexe d'isolement de l'ADN. Les plasmides sont de l'ADN extrachromosomique présent dans la plupart des cellules bactériennes. Ce sont des ADN circulaires dormants qui permettent aux bactéries de survivre dans des conditions environnementales difficiles. L'ADN plasmidique est constitué de gènes résistants spéciaux qui apportent des avantages supplémentaires aux bactéries, tels que la résistance aux antibiotiques, les propriétés de virulence et les propriétés toxiques..

Figure 02: Isolement de l'ADN plasmidique

L'isolement de l'ADN plasmidique implique également trois processus principaux; lyse cellulaire, protéinolyse et précipitation de l'ADN. Bien que le mécanisme biochimique de l'isolement soit similaire à celui de l'isolement de l'ADN génomique, le processus est plus complexe que cela. Le processus de lyse cellulaire est le processus le plus important dans cette procédure. Plus important encore, l’ADN génomique et l’ADN plasmidique ne doivent pas être mélangés. Par conséquent, un processus de lyse beaucoup plus doux est incorporé à la procédure d’isolement de l’ADN plasmidique. Par conséquent, dans la plupart des procédures d’isolation d’ADN plasmidique, utilisez le détergent; dodécylsulfate de sodium pour la lyse cellulaire.

Quelles sont les similitudes entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique??

• L'isolation de l'ADN génomique et de l'ADN plasmidique se concentre sur l'extraction de l'ADN d'un organisme.
• En outre, les deux suivent le même processus global qui inclut la lyse cellulaire, la dégradation des protéines et la précipitation de l'ADN.
• De plus, l'ADN résultant des deux processus est important pour les processus en aval.
• De plus, les deux processus d'isolation comprennent les étapes pour purifier et stocker l'ADN dans des conditions de stockage spécifiées.
• De plus, la protéinase K est utilisée dans les deux méthodes pour dégrader les protéines.

Quelle est la différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique?

L'isolation de l'ADN génomique se concentre sur l'extraction de l'ADN génomique entier de l'organisme cible, tandis que l'isolation de l'ADN plasmidique se concentre sur l'isolement de l'ADN plasmidique de l'espèce bactérienne particulière. C’est donc la principale différence entre l’isolation d’ADN génomique et d’ADN plasmidique. De plus, une autre différence entre l'isolement de l'ADN génomique et celui de l'ADN plasmidique réside dans la procédure. L'isolement de l'ADN génomique est une procédure moins complexe que l'isolement de l'ADN plasmidique. Par conséquent, lors de l'isolement de l'ADN plasmidique, il est nécessaire de prendre des précautions pour éviter le mélange d'ADN génomique et plasmidique..

L’infographie ci-dessous fournit des détails supplémentaires sur la différence entre l’ADN génomique et l’isolement de l’ADN plasmidique..

Résumé - ADN génomique vs isolement d'ADN plasmidique

L'isolement de l'ADN est un processus important dans les techniques de biologie moléculaire. Il existe deux types d'ADN, à savoir l'ADN génomique et l'ADN plasmidique (ADN extra-chromosomique). Sur la base des exigences, certaines procédures ont été utilisées pour isoler l’ADN génomique, alors que certaines procédures ont pour objet d’isoler uniquement l’ADN plasmidique de bactéries. Par conséquent, les étapes impliquées dans les deux processus diffèrent légèrement les unes des autres. Cependant, le processus global est le même dans les deux isolements. L'ADN isolé des deux processus est extrêmement utile dans les processus en aval tels que le clonage, l'électrophorèse sur gel et les réactions en chaîne de la polymérase. À la fin du protocole d'isolation de l'ADN génomique, tout l'ADN génomique de l'organisme peut être isolé en tant que produit final, tandis qu'à la fin du protocole d'isolation de l'ADN plasmidique, l'ADN plasmidique de la bactérie respective peut être isolé en tant que produit final. C’est donc la différence entre l’ADN génomique et l’isolement de l’ADN plasmidique..

Référence:

1. "EXTRACTION D'ADN DE BACTÉRIES." Extraction d'ADN à partir de bactéries. Disponible ici 

Courtoisie d'image:

1. "Extraction de l'ADN" Par Joo Nath - Travail personnel, (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons 
2. ”Miniprep plasmidique” de Retama - Travail personnel, (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons