Différence entre électrophorèse sur gel et SDS PAGE

le différence principale entre électrophorèse sur gel et SDS PAGE est que L'électrophorèse sur gel est une technique utilisée pour séparer l'ADN, l'ARN et les protéines alors que la SDS PAGE est un type d'électrophorèse sur gel utilisée principalement pour séparer les protéines.. En règle générale, SDS PAGE donne une meilleure résolution que l'électrophorèse sur gel ordinaire.  

L'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE sont des techniques biotechnologiques permettant de séparer les macromolécules en fonction de la charge et de la taille. En règle générale, l'électrophorèse sur gel utilise des stabilisants en gel d'agarose pour la séparation, tandis que SDS PAGE utilise des stabilisants en gel de polyacrylamide..  

Zones clés couvertes 

1. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel?
     - Définition, procédure, importance
2. Qu'est-ce que SDS PAGE?
     - Définition, procédure, importance
3. Quelles sont les similitudes entre l'électrophorèse sur gel et SDS PAGE
     - Aperçu des caractéristiques communes
4. Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel et SDS PAGE
     - Comparaison des différences clés

Mots-clés: agarose, ADN, électrophorèse sur gel, polyacrylamide, protéines, SDS PAGE 

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel? 

L'électrophorèse sur gel est une technique qui sépare des fragments de macromolécules tels que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Au cours de l'électrophorèse sur gel, les macromolécules se déplacent sous l'influence d'un champ électrique sur une matrice de gel, qui contient des pores à travers lesquels se déplacent les macromolécules. L'électrophorèse sur gel est la technique générale d'analyse de l'ADN issu des techniques de PCR, RFLP, clonage, séquençage de l'ADN ou transfert. Les nanoparticules peuvent également être séparées par électrophorèse sur gel. Le gel est préparé à partir d’un polysaccharide appelé agarose dérivé d’algues. Les gels d'agarose sont constitués de molécules d'agarose à longue chaîne liées entre elles sous la forme d'une toile d'araignée. le vidéo 1 décrit la préparation d'un gel d'agarose. 

L'ADN et l'ARN contiennent des groupes phosphate au niveau de chacun de leurs nucléotides monomères. Par conséquent, ils possèdent une charge négative égale dans toute la molécule. De plus, ils migrent vers l'électrode positive sous le champ électrique. La vitesse de migration dépend de la taille de l'acide nucléique. Les molécules les plus courtes migrent plus rapidement à travers les pores tandis que les plus grosses prennent du temps.  

Figure 1: Bandes d'ADN sur un gel d'agarose

Qu'est-ce que SDS PAGE? 

SDS PAGE (électrophorèse sur gel de dodécylsulfate de sodium et de polyacrylamide de sodium) est une technique analytique utilisée pour séparer les molécules chargées en fonction de la taille. Dans ce processus, le SDS est utilisé pour isoler les protéines en les dénaturant. Comme SDS est un détergent; elle perturbe la structure tertiaire des protéines, ramenant ainsi la protéine repliée en une molécule linéaire. En outre, il enrobe cette molécule protéique linéaire avec une charge négative uniforme. SDS PAGE se compose de deux gels avec des concentrations différentes. La couche supérieure est appelée le gel d'empilement dans lequel les échantillons sont chargés, tandis que la couche inférieure est appelée le gel de résolution. La concentration de gel d’empilement en Polyacrylamide est comprise entre 3,5 et 4% (taille des pores importante) et elle concentre les protéines dans une bande. La concentration de polyacrylamide dans le gel de résolution est de 4-20% (taille de pore faible) et il sépare les protéines en fonction de leur taille. le vidéo 2 montre la préparation d'une page SDS. 

SDS PAGE fournit une séparation rapide des protéines, facilitant les analyses ultérieures telles que le Western blotting.  

Figure 2: Bandes de protéines sur la page SDS

Comme le pouvoir de résolution de SDS PAGE est supérieur à celui d'un gel d'agarose ordinaire, SDS PAGE permet de séparer de petits fragments d'ADN de 5 à 500 pb..  

Similitudes entre l'électrophorèse sur gel et la PAGE SDS 

• L'électrophorèse sur gel et la SDS PAGE sont des techniques qui séparent les macromolécules en fonction de leur charge et de leur taille.. 
• Les deux techniques utilisent un point de gel avec de petits pores à travers lesquels les macromolécules se déplacent. 
• La force motrice est la différence de potentiel entre les deux électrodes. 

Différence entre électrophorèse sur gel et SDS PAGE 

Définition 

Électrophorèse sur gel: Technique utilisée pour séparer des fragments de macromolécules tels que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille et de leur charge

PAGE SDS: Une technique analytique utilisée pour séparer les molécules chargées en fonction de la taille 

Composition 

Électrophorèse sur gel: Égal sur tout le gel; composé d'agarose 

PAGE SDS: Deux gels avec des concentrations différentes; composé de polyacrylamide 

Exécuter la configuration 

Électrophorèse sur gel: Course horizontale 

PAGE SDS: Course verticale 

Méthodologie de casting 

Électrophorèse sur gel: Définit comme il se refroidit 

PAGE SDS: Ensembles par réaction chimique 

Taille des pores 

Électrophorèse sur gel: La taille des pores n'est pas uniforme. plus la concentration en agarose est élevée, plus la taille des pores est petite 

PAGE SDS: La taille des pores est uniforme. le rapport de l'acrylamide au bisacrylamide détermine la taille des pores 

Concentration 

Électrophorèse sur gel: 0,5-2%  

PAGE SDS: 6-15% 

Séparation 

Électrophorèse sur gel: 50-20 000 pb d'acides nucléiques 

PAGE SDS: 5-250 000 Da de protéines 

Conditions 

Électrophorèse sur gel: Généralement exécuté dans des conditions indigènes 

PAGE SDS: Conditions de dénaturation 

Préparation 

Électrophorèse sur gel: Simple 

PAGE SDS: Un processus complexe 

La coloration 

Électrophorèse sur gel: Au bromure d'éthidium 

PAGE SDS: Coloration au Coomassie ou coloration à l'argent  

Conclusion 

L'électrophorèse sur gel est une technique analytique qui sépare les macromolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines en fonction de leur taille. SDS PAGE est un type d'électrophorèse sur gel principalement utilisé pour séparer les protéines dans des conditions de dénaturation. SDS PAGE a un pouvoir de résolution supérieur à celui de l’électrophorèse sur gel classique. La principale différence entre l’électrophorèse sur gel et la SDS PAGE réside dans le type de macromolécules séparées et leur procédure.. 

Référence:

1. “Électrophorèse sur gel.” Khan Academy, disponible ici
2. «Électrophorèse sur gel de polyacrylamide SDS (SDS-PAGE).» Institut Diamantina, 26 avril 2017, disponible ici.

Courtoisie d'image:

1. «Electrophorèse sur gel 2" de Von Mnolf - Photo prise à Innsbruck, en Autriche (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia 
2. “Coomassie3" de Yikrazuul - Travail personnel (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia