Différence entre VNTR et STR

Différence principale - VNTR vs STR

L'ADN répétitif est le modèle des acides nucléiques qui se produisent en plusieurs copies dans le génome. Ils constituent des proportions majeures de l'ADN nucléaire chez les eucaryotes. Les répétitions en tandem sont l’un des principaux types d’ADN répétitif qui copie des unités de séquence répétitives adjacentes, formant ainsi un bloc de nucléotides. VNTR (répétitions en tandem à nombre variable) et STR (répétitions en tandem courtes) sont deux types de répétitions en tandem présentes dans le génome eucaryote. VNTR est un type d'ADN minisatellite tandis que STR est un type d'ADN microsatellite. le différence principale entre VNTR et STR est que l'unité répétitive de VNTR est de 10 à 60 paires de bases alors que l'unité répétitive de STR est de 2 à 6 paires de bases.

Zones clés couvertes

1. Qu'est-ce que VNTR?
     - Définition, caractéristiques, importance
2. Qu'est-ce que STR?
     - Définition, caractéristiques, importance
3. Quelles sont les similitudes entre VNTR et STR
     - Aperçu des caractéristiques communes
4. Quelle est la différence entre VNTR et STR
     - Comparaison des différences clés

Termes clés: génétique médico-légale, microsatellite, minisatellite, unités nucléotidiques récurrentes, STR, répétitions en tandem, VNTR

Qu'est-ce que VNTR?

VNTR fait référence à un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (10 à 60 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier. Par conséquent, VNTR est également appelé minisatellites. Les VNTR sont dispersées dans les chromosomes du génome eucaryote. En règle générale, le nombre d'unités répétées dans un VNTR varie d'un individu à l'autre. Par conséquent, la longueur du tableau formé par les VNTR varie également entre les individus. Comme le nombre de chromosomes variant de parents est hérité, ils peuvent être utilisés dans l'identification parentale ou personnelle. La variation des VNTR chez six individus est montrée dans Figure 1.

Figure 1: Variation VNTR chez les individus

Les VNTR sont les premiers types de polymorphismes utilisés dans le profilage de l'ADN pour déterminer les caractéristiques de l'ADN d'une personne donnée. Ils sont également utilisés comme marqueurs génétiques dans le RFLP (polymorphisme de la longueur des fragments de restriction), technique utilisant la PCR, l'électrophorèse sur gel et la production de motifs de bandes par Southern blot.. 

Qu'est-ce que STR?

STR désigne un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (2-6 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier. Les STR sont un type de microsatellites et sont également connues sous le nom de répétitions de séquences courtes (SSR) en génétique végétale. Les unités répétitives composées d'un seul nucléotide sont appelées polymorphisme d'un nucléotide (SNP). Les STR sont le type le plus commun de polymorphismes génétiques analysés actuellement en génétique médico-légale. Le profilage de l'ADN avec l'utilisation de STR comme marqueurs génétiques est présenté dans Figure 2.

Figure 2: Profilage d'ADN

Des mutations dans certaines des régions STR conduisent à des maladies génétiques telles que le syndrome de l'X fragile et la maladie de Huntington.

Similitudes entre VNTR et STR

• VNTR et STR sont deux types de répétition en tandem.
• VNTR et STR sont des régions structurelles du génome eucaryote.
• VNTR et STR sont constitués d’ADN non codant.
• BothVNTR et STR sont hérités des parents.
• VNTR et STR sont tous deux composés de séquences répétitives, disposées les unes à côté des autres dans un tableau.
• VNTR et STR produisent un polymorphisme génétique.
• Le VNTR et le STR sont répartis dans le génome.
• VNTR et STR sont tous deux utilisés comme marqueurs génétiques en génétique médico-légale.
• Des mutations dans le VNTR et le STR conduisent à des maladies génétiques.

Différence entre VNTR et STR

Définition

VNTR: VNTR est un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (10 à 60 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier..

STR: STR est un type de répétition en tandem dans lequel une courte séquence de nucléotides (2-6 paires de bases) est répétée un nombre variable de fois dans un locus particulier..

Nombre de nucléotides répétés 

VNTR: VNTR est constitué de 10 à 60 paires de bases.

STR: STR est composé de 2-6 paires de bases.

Type d'ADN répétitif

VNTR: VNTR est un type d'ADN minisatellite.

STR: STR est un type d'ADN microsatellite.

Nombre de répétitions

VNTR: VNTR est constitué de 10 à 1 500 répétitions dans le tableau.

STR: STR consiste en 5 à 200 répétitions dans le tableau.

Taille du tableau

VNTR: VNTR forme un tableau de 0.5-15 kb.

STR: STR forme un tableau de 10-1000 pb.

Complexité du tableau

VNTR: VNTR produit des tableaux hétérogènes.

STR: STR produit des tableaux homogènes.

Conclusion

VNTR et STR sont deux types de répétition en tandem qui forment des réseaux d'unités répétitives adjacentes dans le génome eucaryote. Le VNTR est constitué de longues unités répétées de nucléotides (10 à 60 paires de bases). La STR est constituée de courtes unités répétées de nucléotides (2-6 pb). La principale différence entre VNTR et STR est la longueur des unités répétitives de chaque type de répétition en tandem..

Référence:

1. «Répétition en tandem avec un nombre variable». Rubriques ScienceDirect, disponibles ici.
2. «La science de la génétique médico-légale». CRG - Conseil pour une génétique responsable, disponible ici.

Courtoisie d'image:

1. “D1S80Demo” Par PaleWhaleGail sur Wikipedia anglais (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Les étapes de la détermination des empreintes génétiques» Par Sneptunebear16 - Propre travail (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia