Différence entre gel d'empilage et gel de séparation

Différence clé - Gel d'empilement vs séparation Gel
 

Les termes gel d'empilement et gel de séparation sont utilisés pour expliquer la technique SDS-PAGE. L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide et de dodécylsulfate de sodium est une technique de laboratoire utilisée pour séparer les molécules de protéines en fonction de leur poids moléculaire. La théorie sous-jacente à cette technique est que les protéines de poids moléculaires différents présentent des taux de migration différents; les molécules de faible poids moléculaire migrent plus rapidement, tandis que les molécules de haut poids moléculaire migrent lentement. Le milieu de migration est un gel. Il existe deux types de gels nommés gel d'empilement et gel séparateur. le différence clé entre gel d’empilement et gel séparateur est que le pH du gel d'empilement est de 6,8 alors que le pH du gel de séparation est de 8,8.

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que le gel d'empilage?
3. Qu'est-ce que le gel de séparation?
4. Relation entre gel d'empilage et gel de séparation
5. Comparaison côte à côte - Gel d'empilement vs gel de séparation sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le gel d'empilage??

Le gel de superposition est un gel de polyacrylamide faiblement concentré qui est placé sur le dessus du gel de résolution plus concentré (gel de séparation) dans la technique SDS-PAGE. Le gel d'empilement est utilisé pour améliorer la résolution de l'électrophorèse. La résolution augmente en raison de la différence entre les concentrations de gel d'empilement et de gel de résolution qui agissent sur les protéines de l'échantillon. Étant donné que la concentration de polyacrylamide dans le gel d'empilement est faible, la taille des pores est plus élevée. Cela contribue également à augmenter la séparation.

Le gel d'empilement est un gel de polyacrylamide en vrac avec de gros pores d'environ 7% de Polyacrylamide. Ces pores ne constituent pas une barrière considérable pour les grosses molécules de protéines. Par conséquent, ce gel affecte légèrement la mobilité de ces protéines. Cela permet une séparation en fonction de la mobilité et de la taille de la protéine en les concentrant entre deux gels..

Figure 01: Gel d'acrylamide SDS-PAGE

Le pH du gel d'empilement est de 6,8. Son pH est plus acide que celui du gel de résolution de 2 unités de pH. Ce pH implique une force ionique plus faible d'où une résistance électrique plus élevée. Cela provoque la mobilité des protéines par rapport aux autres particules chargées présentes dans le gel..

Qu'est-ce que le gel de séparation??

Le gel de séparation ou le gel de résolution d’une technique SDS-PAGE est un gel de polyacrylamide hautement concentré qui est placé sur le dessus d’un gel d’empilement peu concentré. Le gel de séparation contient une grande quantité de polyacrylamide (10%). Le pH de ce gel est maintenu à pH = 8,8, ce qui correspond à un pH supérieur à celui du gel de superposition..

Figure 02: Appareil d'électrophorèse sur gel

Lorsque les molécules de protéines atteignent le gel de séparation, leur migration est ralentie car le gel de séparation est un gel à concentration élevée avec une petite taille de pores pouvant constituer une barrière considérable au mouvement des molécules de protéines. Ce ralentissement permet aux autres protéines de migrer lentement de se rattraper, ce qui crée une bande étroite et concentrée entre les deux gels..

Quelle est la relation entre gel d'empilage et gel de séparation?

• Les deux types de gel d’empilement et de gel de séparation sont utilisés dans le même appareil.

Quelle est la différence entre gel d'empilage et gel de séparation?

Gel d'empilement vs gel de séparation
Le gel de superposition est un gel de polyacrylamide faiblement concentré qui est placé sur le dessus du gel de résolution plus concentré (gel de séparation) en technique SDS-PAGE.	Le gel de séparation ou le gel de résolution d'une technique SDS-PAGE est un gel de polyacrylamide hautement concentré qui est placé sur le dessus d'un gel d'empilement peu concentré.
Placement
Le gel d’empilement est placé sur le gel de séparation (séparateur).	Le gel de séparation est placé au fond du récipient utilisé pour l’électrophorèse sur gel.
Concentration
La concentration de gel d'empilement est élevée.	La concentration de gel séparant est faible.
Teneur en polyacrylamide
Le gel d’empilement contient environ 7% de Polyacrylamide.	Le gel de séparation contient environ 10% de Polyacrylamide.
pH
Le pH du gel d’empilement est de 6,8.	Le pH du gel séparateur est de 8,8.
Taille des pores
De grandes tailles de pores sont présentes dans le gel d'empilage.	De petites tailles de pores sont présentes dans le gel de séparation.
Résolution
Le gel d'empilage donne une meilleure résolution.	La séparation du gel donne une mauvaise résolution.

Résumé - Gel d'empilage vs séparation Gel

Le gel d’empilement et le gel de séparation sont deux types de gels de Polyacrylamide utilisés pour obtenir une meilleure séparation des molécules de protéines dans un échantillon donné. La différence entre le gel d’empilement et le gel de séparation réside dans le fait que le pH du gel d’empilement est de 6,8 alors que le pH du gel de séparation est de 8,8..

Référence:

1. «Électrophorèse sur gel de polyacrylamide». Électrophorèse sur gel de polyacrylamide (théorie): laboratoire virtuel de biologie moléculaire II: biotechnologie et génie biomédical: laboratoire virtuel Amrita Vishwa Vidyapeetham. Disponible ici  
2. «Comment fonctionne SDS-PAGE». Bitesize Bio, 16 février 2018. Disponible ici
3. «Gel d’empilement SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)». Google Sites. Disponible ici 

Courtoisie d'image:

1.'SDS-PAGE Acrylamide gel'By Bensaccount sur Wikipedia anglais, (CC BY 3.0) via Wikimedia Commons  
2. «Appareil d'électrophorèse de gel» de Jeffrey M. Vinocur - Travail personnel,  (CC-BY 2.5) via Wikimedia Commons