L'agarose et le Polyacrylamide sont tous deux des polymères solubles dans l'eau mais, entre eux, de nombreuses différences peuvent être observées, à partir de leur origine. L’agarose et le polyacrylamide ont tous deux une capacité commune à former des matrices de gel poreuses. Malgré cela, il existe un certain nombre de différences distinctes entre les deux. Les principales différences entre ces deux polymères résident dans leur nature d'origine, leur structure chimique, leurs utilisations différentes et leurs performances en termes d'électrophorèse sur gel..
Agarose est un polymère linéaire naturel dérivé à son tour d'un polymère complexe appelé agar trouvé dans les algues. L’agarose est extrait de la gélose par élimination de son composant protéique appelé agaropectine. L'agarose est ce qui donne à l'agar sa capacité à former des gels.
L'agarose est principalement utilisé dans les études de microbiologie et de biologie moléculaire. Dans les études microbiologiques, l'agarose, lorsqu'il est complété par des nutriments appropriés, fournit une base solide pour la culture de micro-organismes tels que les bactéries et les champignons. Utilisé à des concentrations semi-solides, il peut être utile pour évaluer la motilité de ces microorganismes. En biologie moléculaire, il constitue un outil important pour l’un des processus de résolution les plus fondamentaux appeléélectrophorèse sur gel' ou 'électrophorèse sur gel d'agarose'(AGE). L'électrophorèse sur gel est un processus qui permet la résolution ou la séparation des acides nucléiques ou des protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Ici, l’agarose sert de gel poreux semblable à un tamis à travers lequel la séparation se produit.
Structure d'agarose
Le polyacrylamide est un polymère synthétique et est utilisé dans une grande variété d'industries. Comme mentionné précédemment, son utilisation repose sur sa capacité à former des gels. Cependant, sa capacité à retenir et à drainer l’eau à différentes concentrations est également exploitée par diverses industries..
Le plus répandu et le polyacrylamide est couramment utilisé dans le traitement des eaux usées. Ici, il est utilisé comme agent floculant pour éliminer toute matière organique en suspension; par conséquent, améliorer la turbidité et clarifier l'eau. Le polyacrylamide est une autre utilisation dans l'industrie du papier. Ici, il est utilisé pour retenir ou drainer l’eau de la pâte à papier selon les besoins. De même, dans les industries de l'agriculture et de la construction, il est utilisé comme conditionneur de sol pour prévenir l'érosion du sol et améliorer sa qualité..
Comme l’agarose, le polyacrylamide est également utilisé en biologie moléculaire comme un outil de résolution important dans un processus similaire appeléÉlectrophorèse sur gel de polyacrylamide '(PAGE). En plus de tout cela, le Polyacrylamide est également utilisé dans le traitement du minerai et la fabrication de l'agent de floculation afin d'éliminer toute matière organique en suspension; par conséquent, améliorer la turbidité et clarifier l'eau. Le polyacrylamide est une autre utilisation dans l'industrie du papier. Ici, il est utilisé pour retenir ou drainer l’eau de la pâte à papier selon les besoins. De même, dans les secteurs de l'agriculture et de la construction, il est utilisé comme conditionneur de sol pour prévenir l'érosion du sol et améliorer sa qualité. En plus de tout cela, le Polyacrylamide est également utilisé dans la fabrication d’additifs alimentaires, de lentilles de contact souples et de textiles..
Structure de polyacrylamide
Agarose: L'agarose est un polymère d'origine naturelle. Il est dérivé d'algues.
Polyacrylamide: Le polyacrylamide est d'origine synthétique et ne se trouve dans aucune circonstance naturelle.
Agarose: La formule moléculaire de l'agarose est C24H38O19.
Polyacrylamide: La formule moléculaire du polyacrylamide est (C 3H5NON)n.
Agarose: L'agarose est un polysaccharide linéaire. Il est constitué d’unités disaccharidiques répétitives appelées agrobiose maintenues ensemble par des liaisons hydrogène..
Polyacrylamide: Le polyacrylamide est un polymère chimiquement réticulé. Il est composé de monomères d’acrylamide et d’un agent de réticulation N, N'-méthylènebisacrylamide.
Agarose: L'agarose et son agrobiose monomère sont de nature non toxique.
Polyacrylamide: L'unité monomère du polyacrylamide, l'acrylamide, est un cancérigène présumé et une neurotoxine connue, alors que sa forme polymérisée est de nature non toxique..
Agarose: La préparation de gel d'agarose pour AGE prend moins de temps, est simple et ne nécessite pas d'initiateur ni de catalyseur de polymérisation.
Polyacrylamide: La préparation de gel de polyacrylamide pour PAGE prend beaucoup de temps et est fastidieuse et nécessite également un initiateur (persulfate d'ammonium) et un catalyseur de polymérisation (N, N, N ', N'-tétraméthyléthylendiamine - TEMED).
Les gels de polyacrylamide sont chimiquement plus stables que les gels d'agarose.
À la même concentration, les matrices de gel de Polyacrylamide ont tendance à avoir des pores plus petits que ceux d’une matrice de gel d’agarose..
La taille des pores des gels de Polyacrylamide peut être modifiée de manière plus contrôlée que celle des gels d'agarose..
Les gels de polyacrylamide ont un pouvoir de résolution élevé, tandis que les gels d'agarose ont un pouvoir de résolution faible.
Les gels de polyacrylamide peuvent contenir de plus grandes quantités d'acide nucléique que les gels d'agarose pour la résolution.
Images de courtoisie: Agarose et Structure de polyacrylamide via Wikicommons (domaine public)