Différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome

le différence clé entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l’exome est que le le séquençage du génome entier séquence le génome entier d'un organisme tandis que le séquençage de l'exome ne séquence que l'exome ou les gènes codant pour la protéine d'un organisme.

Le séquençage est une technique qui détermine l'ordre précis des nucléotides dans une molécule d'ADN particulière. Cela reflète simplement le bon ordre des quatre bases; l'adénine (A), la guanine (G), la cytosine (C) et la thymine (T) dans un fragment d'ADN. Il existe plusieurs méthodes de séquençage telles que le séquençage Sanger, le séquençage de prochaine génération, etc. En outre, le génome complet d'un organisme (séquençage du génome entier) ou uniquement les gènes codant pour la protéine du génome (séquençage d'exome).

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que le séquençage du génome entier?
3. Qu'est-ce que le séquençage Exome?
4. Similitudes entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome
5. Comparaison côte à côte - séquençage du génome entier vs séquençage de l'exome sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le séquençage du génome entier??

Le génome humain contient près de trois milliards de paires de bases d'ADN. Le séquençage du génome entier est une méthode qui séquence le génome complet d'un organisme. Par conséquent, dans le séquençage du génome entier, il convient de prendre en compte l'ensemble des molécules d'ADN, y compris les exomes, les introns, les espaces intergéniques, etc..

Figure 01: Séquençage du génome entier

Lors de la préparation de ce séquençage, la première étape consiste à extraire l’ADN entier. Ensuite, l'ADN extrait subit la procédure de séquençage en utilisant un procédé de séquençage approprié. En analysant les séquences obtenues à l'aide d'un outil bioinformatique, nous pouvons découvrir les maladies rares, le cancer, les maladies infectieuses, etc..

Qu'est-ce que le séquençage Exome??

L'exome est une partie du génome qui contient environ 1,5% du génome et constitue la collection d'exons. Les exons sont les séquences qui se transcrivent en ARNm puis en produit protéique final. Par conséquent, le séquençage de l'exome séquence la totalité des séquences codant pour la protéine dans le génome. Le séquençage de l'exome révèle les troubles génétiques car la plupart des troubles génétiques sont dus aux mutations des gènes codant pour les protéines. Par conséquent, les processus de diagnostic des troubles génétiques utilisent fréquemment le séquençage de l'exome comme méthode de diagnostic de la maladie. En outre, lorsqu’on compare avec l’application du séquençage du génome complet pour les tests génétiques, le séquençage de l’exome prend moins de temps et est moins coûteux..

Figure 02: Séquençage de l'exome

Dans le séquençage de l'exome, il est tout d'abord nécessaire de sélectionner uniquement les séquences codant pour la protéine dans l'ADN total. Notez que les humains ont environ 180000 séquences codant pour les protéines. Ensuite, l’exome est séquencé en utilisant une méthode de séquençage à haut débit.

Quelles sont les similitudes entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome?

• Le séquençage du génome entier et le séquençage Exome sont deux applications du séquençage.
• Les deux méthodes sont utiles pour déterminer le bon ordre de la séquence de nucléotides dans les deux méthodes..
• En outre, la bioinformatique aide les deux techniques à analyser les données.

Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome?

Le séquençage du génome entier séquence l'ADN entier du génome d'un organisme, tandis que l'exome séquençage ne séquence que les séquences codant pour la protéine du génome. C'est donc la différence fondamentale entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome. De plus, bien que les deux méthodes soient largement utilisées pour déterminer le bon ordre de la séquence des nucléotides, le séquençage du génome entier est coûteux et prend du temps par rapport au séquençage de l'exome..

L’infographie ci-dessous présente la différence entre le séquençage du génome entier et celui de l’exome..

Résumé - Séquençage du génome entier vs séquençage de l'exome

Le séquençage révèle l'ordre précis des bases dans un fragment d'ADN et il peut s'agir du séquençage du génome entier ou du séquençage de l'exome. Ici, le séquençage du génome entier séquence le génome complet d'un organisme alors que le séquençage de l'exome ne séquence que les séquences codant pour la protéine du génome. Compte tenu de leurs applications, le séquençage du génome entier est utile pour analyser les aberrations génétiques telles que variations d'un seul nucléotide, délétions, insertions, etc. dans le génome entier, tandis que le séquençage d'exome est utile pour détecter les maladies génétiques. C’est donc la différence entre le séquençage du génome entier et celui de l’exome..

Référence:

1. «Séquençage du génome entier par rapport à un exome entier par opposition à des panneaux de séquençage ciblés». Healio, SLACK Incorporated. Disponible ici  
2. «Que sont le séquençage de l'exome entier et le séquençage du génome entier? - Genetics Home Reference - NIH. ”Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, Instituts nationaux de la santé. Disponible ici  

Courtoisie d'image:

1. «Séquençage total des armes à feu par opposition au séquençage hiérarchique», par Commins, J., Toft, C., Fares, M. A. - «Méthodes de biologie computationnelle et leur application à la génomique comparative des bactéries bactériennes endocellulaires symbiotiques des insectes». (CC BY-SA 2.5) via Wikimedia Commons  
2. “Exome Sequencing Workflow 1a” de SarahKusala - Travail personnel, (CC BY 3.0) via Wikimedia Commons