Différence entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotides

Différence clé entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotide
 

L'ADN est fréquemment soumis à des dommages en raison de divers facteurs internes et externes. Cependant, les systèmes de réparation cellulaire corrigent immédiatement et constamment les dommages avant qu’ils ne deviennent des mutations ou avant qu’ils ne soient transférés aux générations suivantes. Il existe trois types de systèmes de réparation de l'excision dans les cellules: la réparation par excision de nucléotide (NER), la réparation par excision de base (BER) et la réparation de mismatch d'ADN (MMR) pour réparer les dommages à l'ADN simple brin. La principale différence entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotide est que la réparation par excision de base est un système de réparation simple qui fonctionne dans les cellules pour réparer les dommages causés par un nucléotide simple de manière endogène tandis que La réparation par excision de nucléotide est un système de réparation complexe qui agit dans les cellules pour réparer des régions endommagées comparativement plus grandes et provoquées de manière exogène..

CONTENU
1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que la réparation par excision de base?
3. Qu'est-ce que la réparation par excès de nucléotide?
4. Comparaison côte à côte - Réparation par excision de base vs Réparation par excision de nucléotide
5. Résumé

Qu'est-ce que la réparation par excision de base??

La réparation par excision de base est la version la plus simple du système de réparation de l'ADN des cellules. Il est utilisé pour réparer des dommages mineurs dans l'ADN. Les bases d'ADN sont modifiées par désamination ou alkylation. Lorsque la base est endommagée, l'ADN glycosylase reconnaît et active le système de réparation par excision de base et le récupère à l'aide des enzymes endonucléase AP, ADN polymérase et ADN ligase. Les étapes suivantes sont impliquées dans le système BER.

1. Reconnaissance et élimination d'une base incorrecte ou endommagée par une ADN glycosylase pour créer un site abasique (sites de perte de bases - sites apiuriniques ou apyrimidiniques).
2. Incision de site abasique par une endonucléase apurinique / apyrimidinique
3. Enlèvement du fragment de sucre restant par une lyase ou une phosphodiestérase
4. Comblement des lacunes par une ADN polymérase
5. Scellement du pseudo par une ADN ligase

Figure 01: Voie de réparation de l'excision de base

Qu'est-ce que la réparation par excès de nucléotide??

Nucleotide Excision Repair (NER) est un système important de réparation de l’excision de l’ADN dans les cellules. Il est capable de réparer et de remplacer les régions endommagées jusqu’à 30 bases de longueur et il est dirigé par le brin de matrice non endommagé. Le rayonnement ultraviolet endommage couramment l'ADN, et le NER protège l'ADN en réparant ces dommages immédiatement avant de devenir des mutations et de passer aux générations futures ou de provoquer des maladies. Le NER assure spécifiquement une protection contre les mutations causées indirectement par des facteurs exogènes tels que des cancérogènes environnementaux et chimiques. Le TNS est observé dans presque tous les organismes et il reconnaît les dommages qui provoquent une distorsion importante de l'hélice de l'ADN..

Le processus NER implique l'action de nombreuses protéines telles que XPA, XPB, XPC, XPD, XPF, XPF, XPG, CSA, CSB, etc., et utilise plusieurs mécanismes de type copier / coller. Ces protéines sont essentielles à l'achèvement du processus de réparation. Un défaut de l'une des protéines NER est vital et peut provoquer des syndromes récessifs rares: xeroderma pigmentosum (XP), syndrome de Cockayne (CS) et forme photosensible du trouble des cheveux trichothiodystrophie (TTD).

Figure 02: Réparation par excision de nucléotides

Quelle est la difference entre Base Excision Repair et Nucleotide Excision Repair??

Réparation par excision de base vs réparation par excès de nucléotide
Réparation par excision de base (BER) est un système de réparation de l'ADN se produit dans les cellules.	La réparation par excision de nucléotide (NER) est un autre type de système de réparation de l’ADN trouvé dans les cellules.
Reconnaître les adduits à l'ADN
Le BER répare les dommages causés aux petits adduits à l'ADN.	NER répare les grands adduits à l'ADN.
Dommages à l'ADN
Le BER reconnaît les dommages qui ne causent pas de distorsions importantes à l'hélice de l'ADN.	NER reconnaît les dommages qui provoquent des distorsions importantes de l'hélice de l'ADN.
Causes des dommages à l'ADN
Le BER répare les dommages causés par les mutagènes endogènes.	NER répare les dommages causés par des mutagènes exogènes.
Complexité
Le BER est le système de réparation le moins complexe	C'est plus complexe que le BER.
Besoin de protéines
BER ne nécessite pas d'autres protéines.	Le SNER nécessite plusieurs produits géniques, en particulier des protéines, pour distinguer les régions endommagées et non endommagées.
Pertinence
Le BER est adapté à la correction des dommages sur une seule base.	Le NER convient au remplacement des régions endommagées.

Résumé - Réparation base excision vs réparation excision nucléotide

NER et BER sont deux types de processus de réparation de l'excision de l'ADN trouvés dans les cellules. Le BER est capable de réparer de petits dommages causés de manière endogène, tandis que le NER est capable de réparer des régions de dommages jusqu’à 30 paires de base de longueur causées principalement par des facteurs exogènes. Le BER diffère du NER dans les types de substrats reconnus et dans l'événement de clivage initial. Le BER peut également reconnaître des dommages qui ne sont pas causés par des distorsions significatives dans l'hélice de l'ADN, tandis que le NER reconnaît des distorsions importantes de l'hélice de l'ADN. C’est la différence entre la réparation par excision de base et l’excision de nucléotide.

Courtoisie d'image:
1. “Dna repair base excersion fr” de LadyofHats - (Domaine public) via Wikimedia Commons
2. "Une représentation schématique des modèles de la voie de réparation de l'excision des nucléotides contrôlée par les protéines Uvr" Par Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui et Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) via Wikimedia Commons

Références:
1. Kim, Yun-Jeong et David M. Wilson. «Aperçu de la biochimie de la réparation par excision de base». Pharmacologie moléculaire actuelle. Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, janvier 2012. Web. 14 mars 2017.
2. Boer, Jan De et Jan H.J. Hoeijmakers. "Réparation de l'excision de nucléotides et syndromes humains." Carcinogenesis. Oxford University Press, 01 mars 2000. Web. 28 mars 2017
3. Hoogstraten et al. «Détection polyvalente des dommages à l'ADN par la protéine de réparation du xPC, excipient nucléotidique du génome mondial». Journal of Cell Science. The Company of Biologists Ltd, le 01 septembre 2008. Web. 28 mars 2017