Différence entre RNASE A et RNASE H

Différence clé - RNASE A vs RNASE H
 

Les ribonucléases sont des nucléases qui dégradent spécifiquement l'ARN en unités plus petites. Ils peuvent être divisés en deux catégories. les endoribonucléases et les exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui peut dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Il coupe les liaisons phosphodiester au sein d'une chaîne polynucléotidique d'ARN. Les exemples sont la RNase A, la RNase III, la RNase T1, la RNase P et la RNase H. L'exoribonucléase est une exonucléase qui a dégradé l'ARN en éliminant les nucléotides terminaux des extrémités 5 'ou 3' de la molécule d'ARN. Les exemples sont la RNase R, la RNase II, la RNase D et la RNase PH. le différence clé entre RNASE A et RNASE H est que le La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui dégrade spécifiquement l'ARN simple brin en composants plus petits tandis que la RNase H est une enzyme non spécifique qui clive l'ARN de l'hybride ARN-ADN en unités plus petites via le mécanisme hydrolytique..

CONTENU

1. Vue d'ensemble et différence clé
2. Qu'est-ce que RNASE A?
3. Qu'est-ce que RNASE H?
4. Similitudes entre RNASE A et RNASE H
5. Comparaison côte à côte - RNASE A vs RNASE H sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que RNASE A??

La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui coupe spécifiquement les résidus de cytosine et d'uracile non appariés à l'extrémité 3 'de l'ARN simple brin. La RNase H fonctionne à une concentration en sel plus élevée (concentration en NaCl de 0,3 M ou supérieure). La réaction hydrolytique est en deux étapes. Il forme un produit phosphorylé en 3 'via un intermédiaire monophosphate cyclique en 2', 3 '. Bien qu'il soit spécifique à l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée, il peut également dégrader l'ARN double brin et l'ARN dans un hybride ARN-ADN à une concentration inférieure en NaCl (inférieure à 0,3 M en NaCl).

Bruce Merrifield a d'abord synthétisé cette enzyme. La RNase A est une enzyme très populaire dans la recherche moléculaire. La RNase A pancréatique bovine est un exemple de la RNase A. Et c'est l'une des enzymes les plus résistantes utilisées en laboratoire. Cette enzyme n'a pas besoin d'un cofacteur pour son activité. C'est une enzyme hautement thermostable. La RNase A est la première enzyme et la troisième protéine pour lesquelles une séquence d'acides aminés correcte a été détectée. Cette enzyme est très petite avec 124 acides aminés et une masse moléculaire de 12600da. Et il a quatre résidus d'histidine (His 12 et His 119 qui interviennent dans la réaction catalytique).

Figure 01: La RNase A

La RNase A peut être isolée en faisant bouillir un échantillon brut. Lorsque bout, toutes les autres enzymes dégradent la RNase A restante. La RNase A est une enzyme étonnamment stable. Cette enzyme inhibe avec la protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et le vanadate d'uridine.

Qu'est-ce que la RNase H??

La RNase H est une enzyme non spécifique de la ribonucléase qui peut dégrader l’ARN de l’hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. La RNase H coupe la 3'- liaison O-P de l'ARN dans un hybride ARN-ADN. En fin de compte, il produit des produits à terminaison 3'OH et 5 'phosphate. Dans la réplication de l'ADN, il joue un rôle essentiel en éliminant l'amorce d'ARN après la formation de nouveaux brins d'ADN. En laboratoire, il dégrade spécifiquement l'ARN de l'hybride ARN-ADN, mais pas l'ADN et l'ARN non hybridé. Et cette enzyme est généralement utilisée pour détruire la matrice d’ARN après la formation du premier brin d’ADN complémentaire lors de la synthèse de l’ADNc..

Figure 02: RNase H

La RNase H est également utilisée dans les tests de protection contre la nucléase. Il peut également être incorporé à l'élimination de la queue de poly A de l'ARNm. La RNase H a la capacité de détruire l'ARN non codant à l'intérieur et à l'extérieur de la cellule. Les ions métalliques sont nécessaires en tant que cofacteurs pour cette activité protéique. Un chélateur (EDTA) peut être utilisé pour inhiber l'enzyme RNase H.

Quelles sont les similitudes entre RNASE A et RNASE H?

  • Les deux sont de nature protéique.
  • Les deux sont endoribonucléase
  • Les deux peuvent dégrader l'ARN.
  • Les deux effectuent des réactions hydrolytiques.
  • Les laboratoires moléculaires utilisent ces deux.

Quelle est la différence entre RNASE A et RNASE H?

RNASE A vs RNASE H

La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui coupe spécifiquement l'extrémité 3 'des résidus non appariés de cytosine et d'uracile d'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée.. La RNase H est une enzyme non spécifique de la ribonucléase qui peut dégrader l'ARN de l'hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique..
 Nature du clivage d'ARN
La RNase A coupe spécifiquement l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. La RNase H clive l'ARN dans un hybride ARN-ADN.
Besoin de cofacteurs pour l'activité
La RNase A n'a pas besoin de cofacteurs pour son activité. La RNase H a besoin d'ions métalliques comme cofacteurs pour son activité.
 Inhibiteurs de l'activité des protéines
La protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et d'uridine vanadate inhibent l'activité de la RNAse A. Un chélateur (EDTA) inhibe l'activité de la RNase H.
Élimination d'ARN Primer dans la réplication de l'ADN
La RNase A n'est pas utilisée pour éliminer les amorces d'ARN lors de la réplication de l'ADN.. La RNase H est utilisée pour éliminer l’amorce d’ARN dans la réplication de l’ADN
Suppression De Modèles D'ADN Dans La Synthèse D'ADN Complémentaire (C-ADN)
La RNase A n'est pas utilisée pour éliminer les matrices d'ARN lors de la synthèse de l'ADN complémentaire (C-ADN). La RNase H est utilisée pour éliminer les matrices d'ARN lors de la synthèse de l'ADN complémentaire (C-ADN).
Élimination de la queue de poly-A dans l'ARNm hybride en oligo (dt)
La RNase A n’est pas utilisée pour éliminer la «queue poly-A» de l’ARNm hybride à l’oligo (dt). La RNase H est utilisée pour éliminer la «queue poly-A» de l’ARNm hybride à l’oligo (dt)

Résumé - RNASE A vs RNASE H

Les ribonucléases sont des enzymes nucléases capables de cliver l'ARN en unités plus petites. Ils sont deux types; les endoribonucléases et les exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase capable de dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Et il coupe la liaison phosphodiester au sein d'une chaîne polynucléotidique d'ARN. La RNase A et la RNase H sont deux endoribonucléases. La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui coupe spécifiquement les résidus de cytosine et d'uracile non appariés à l'extrémité 3 'de l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. La RNase H est une enzyme non spécifique de la ribonucléase qui peut dégrader l'ARN de l'hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. C'est la différence entre la RNase A et la RNase H.

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Référence:

1. Karuturi, auteur Amrutha. «17 faut connaître les faits sur la RNase A.» AG Blog, 22 février 2017. Disponible ici
2. «Ribonucléase». Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 janvier 2018. Disponible ici  

Courtoisie d'image:

1.'RNase A'By Aucun auteur lisible par machine n'a été fourni. Vossman supposé (sur la base de revendications de droits d'auteur)., (CC BY-SA 2.5) via Wikimedia Commons
2.'RNase H fix'By Aucun auteur lisible par machine n'a été fourni. Vossman supposé (sur la base de revendications de droits d'auteur)., (CC BY-SA 2.5) via Wikimedia Commons